Quando aparece pus na garganta, é apenas uma infecção ou são placas? Fui no médico e ele disse que

Não é porque aparece algo amarelado na garganta que isso seja pus ou que voce tenha uma infecção. Para identificar a diferença só com a experiência do dia a dia e pelo quadro apresentado pelo paciente.
Se esta em dúvida volte e converse com seu médico.

O exame das amígdalas deixa até alguns ororrinolaringologistas em duvida.
As alterações incluem os caseos (acumulo de alimentos e células da boca nos "buraquinhos" das amigdalas) e o exudato (que pode ser entendido como uma secrecao, para simplificar). O exudato pode ser purulento, esbranquiçado, esverdeado, com áreas enegrecidas. O exudato purulento (as chamadas placas de pus) pode aparecer tanto em infecções por vírus como naquelas causadas por bactérias. Viu que difícil? Tudo isso pra explicar que só com uma informação não é possível definir nem o diagnóstico e nem o tratamento. Somente com uma avaliação médica cuidadosa, feita por um médico experiente, você vai ser tratado da melhor maneira, que nem sempre é com antibiótico.