Em caso de vírus resistente, é possível ter carga viral alta e desenvolver sintomas dá fase aguda,

Isso é pouco provável, primeiro porque apresentar sintomas de síndrome retroviral aguda não é muito frequente.
Segundo que, mesmo que haja falha da PEP, ela acaba reduzindo a carga viral o que torna o aparecimento de sintomas de fase aguda mais difíceis, na dúvida é so realizar exame de PCR para HIV, se os sintomas forem referentes ao vírus, o PCR dará positivo, mesmo durante a PEP

Os sintomas da síndrome retroviral aguda ocorrem em cerca de 40 a 60% dos pacientes que contraem o HIV. São caracterizados por febre, manchas pelo corpo, aumento de gânglios entre outros. O esquema atual de Profilaxia pós exposição se iniciado o mais precoce possível, especialmente dentro das 24 a 48 horas após exposição é extremamente eficiente. Ou seja a possibilidade de ter um vírus resistente a ele no Brasil é muito improvável. A carga viral não deve ser utilizada como diagnóstico de infecção pelo HIV durante o uso da Peep, pois a possibilidade de ser negativa é muito alta.