Boa tarde, o meu filho tem 6 anos e teve hipertensão craniana faz uns 3 meses. ele tinha um cisto ar

Boa tarde. O cisto aracnóide é uma alteração que, na maioria das vezes, é benigno (ou seja, não causa qualquer sintoma e não precisa de tratamento). Em alguns casos, principalmente se for grande e a depender da localização, pode causar sintomas, dentre eles dor de cabeça e outros sintomas relacionados a hipertensão intracraniana. Pode ter sido esse o caso do seu filho.
Mesmo após o tratamento cirúrgico, pode acontecer a recidiva (retorno, recrescimento) do cisto e retorno ou manutenção dos sintomas.
Após 3 meses da cirurgia, não é comum ter dor devido à cirurgia.
Assim, sugiro retornar no neurocirurgião que fez a cirurgia do seu filho ou, se indisponível, outro que possa avaliá-lo melhor (inclusive quanto à possibilidade de recidiva e necessidade de novo tratamento).